Структуру органа местного самоуправления Тербунского Второго сельсовета составляют: 

Совет депутатов сельского поселения Тербунский Второй сельсовет Тербунского муниципального района Липецкой области; 
Глава сельского поселения Тербунский Второй сельсовет Тербунского муниципального района Липецкой области; 
Администрация сельского поселения Тербунский Второй сельсовет Тербунского муниципального района Липецкой области. 
Совет депутатов сельского поселения состоит из депутатов, избираемых на муниципальных выборах на основе всеобщего, равного и прямого избирательного права при тайном голосовании сроком на 5 лет. 
Совет депутатов сельского поселения состоит из 10 депутатов.